000のエレナ

（あのガキンチョがそうだってか？）藤沢涼牙は、ある少女を見張っていた。彼女は、多少汚れてはいたものの、ごく普通に見えたーただ一点を除いて。少女の喉元に光り輝く三つのゼロの紋様。それは、神魔の力を意味する“聖なる神魔数”と呼ばれるものだったー十年前、これまで神話の中だけの存在であった神や悪魔、すなわち神魔が、突如現実世界に出現し、破壊と殺戮を始めた。いまや人類は滅亡寸前であった。謎の少女が強大な神魔とひとりで闘っているーそんな噂を聞きつけた人類の対神魔組織“ＡＥＴＯ”は、新米戦闘諜報員の涼牙に、彼女の調査を命じたのだ。少女の名はエレナ。彼女が何者であるのか、まだ誰も知らない…。壮大なハルマゲドン・ストーリーが、ここに始まる。