再現可能性のすゝめ

データ解析とレポート作成の再現性を高めよう。その先には、ボスの笑顔が待っている。 RStudioを使いこなそう。その先には、旨いお鮨が待っている。 Rマークダウンをマスターしよう。その先には、明るい未来が待っている。 　本書はRによる再現可能なデータ解析とレポート作成を身につけるための一冊である。 Rがデータ解析のデファクトスタンダードとなった現在，Rの使い方やRによるさまざまなデータ解析手法についての情報は数多く入手できる。しかしどれだけ立派なデータ解析であっても，結果が再現できなかったり，間違いだらけだったり，時間がかかりすぎて完成しなかったりしたら，価値は半減である。 　本書ではRStudioとRマークダウンについての解説を通して，再現性と信頼性を高め効率を上げるような「データ解析とレポート作成というプロセス」について解説している。データ解析に携わるすべての人に，再現可能性の意義を学び，RStudioとRマークダウンによる再現可能なデータ解析とレポート作成を日々の習慣としてほしい。 Chapter 1　再現可能性のすゝめ 1.1　アドホックなデータ解析とその問題点 1.2　Rスクリプトの導入とその問題点 1.3　再現可能なデータ解析とその問題点 1.4　Rマークダウンによる再現可能なレポート作成 1.5　再現可能なデータ解析とレポート作成のメリット Chapter 2　RStudio入門 2.1　RStudioとは 2.2　RStudioのダウンロードとインストール 2.3　はじめてのRStudio 2.4　まずはRStudioを動かしてみよう 2.5　RStudioでの作業パターン 2.6　タブの紹介 2.7　ツールバー 2.8　メニューバー 2.9　Windowsでの日本語の利用 Chapter 3　RStudioによる再現可能なデータ解析 3.1　Rスクリプトによる解析 3.2　はじめてRスクリプトを使うためのチュートリアル 3.3　プロジェクト機能を利用する 3.4　データの読み込みの自動化 3.5　解析結果の保存の自動化 Chapter 4　RStudioによる再現可能なレポート作成 4.1　再現可能なレポートづくりを目指そう 4.2　Rマークダウンによるレポート作成：最初の一歩 4.3　コードの記述と動作の制御 4.4　ドキュメントの記述 4.5　YAMLヘッダによるレポートのメタデータ設定 4.6　レポート作成の実行 4.7　Rマークダウン編集サポートツール 4.8　Rスクリプトからレポート作成 Chapter 5　Rマークダウンによる表現の技術 5.1　さまざまな形式のレポート作成 5.2　bookdownによる書籍の作成 5.3　flexdashboardでエッセンスを伝える 5.4　htmlwidgetsによるインパクトのある可視化 5.5　表を極めるー正確さと効率の両立 5.6　文献目録の作成 Chapter 6　再現可能性を高める 6.1　バージョン管理システムによる解析プロジェクトの管理 6.2　再現できる環境づくり：packrat編 6.3　パラメータ付きRマークダウン 6.4　R以外の言語エンジンの利用 6.5　外部のRマークダウンとRスクリプトの読み込み 6.6　Rマークダウンで後ろ向き参照 Chapter 7　RStudioを使いこなす 7.1　RStudioのオプション 7.2　コード補完機能 7.3　コードスニペット 7.4　コードの診断 7.5　RStudioによるデバッグ 付録A　マークダウン記法 付録B　チャンクオプション 索引